Директор
Ковзунова Ольга Викторовна
Заместитель директора по научной работе
Ученый секретарь
Головенчик Виктория Ивановна
Сектор бухгалтерского учета
Главный бухгалтер — заведующий сектором
Семкив Мария Николаевна
Сектор правовой, кадровой и организационной работы
Заведующий сектором
Шалесная Елена Николаевна
Спецчасть (подразделение по защите государственных секретов)
Ведущий специалист
Шумская Марина Николаевна
Отдел гидроэкологических исследований
Отдел гидрологии и водоохранных территорий
Начальник отдела
Таврыкина Оксана Михайловна
Начальник отдела
Громадская Елена Ивановна
Отдел мониторинга и государственного водного кадастра
Начальник отдела
Булак Иван Александрович
Отдел нормирования воздействия на окружающую среду
Начальник отдела
Захарко Полина Николаевна
Председатель первичной профсоюзной организации
Младший научный сотрудник
Цубленок Дарья Владимировна